La Comisión de Ética y Deontología de los Colegios Médicos tiene como misión fundamental el velar porque el ejercicio de la profesión discurra por el recto camino que marcan los preceptos éticos, así como difundir el conocimiento de las normas que en él se contemplan entre todos los colegiados y, en general, entre todos los médicos.
Estará integrada por un máximo de 9 y un mínimo de 5 miembros nombrados por el Pleno de la Junta Directiva, con una duración de cuatro años que iniciará con la constitución de caja Junta Directiva y finalizará al término del mandato de esta.